MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Clostridium sp. SY8519

Total Repeats: 51688

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015737	GGT	2	6	321	326	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	339441065
2	NC_015737	AC	3	6	347	352	50 %	0 %	0 %	50 %	339441065
3	NC_015737	GCA	2	6	358	363	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339441065
4	NC_015737	CA	3	6	365	370	50 %	0 %	0 %	50 %	339441065
5	NC_015737	TC	3	6	430	435	0 %	50 %	0 %	50 %	339441065
6	NC_015737	GCCAGC	2	12	507	518	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	339441065
7	NC_015737	GTTC	2	8	535	542	0 %	50 %	25 %	25 %	339441065
8	NC_015737	GCC	2	6	551	556	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	339441065
9	NC_015737	AT	3	6	567	572	50 %	50 %	0 %	0 %	339441065
10	NC_015737	CAG	2	6	623	628	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339441065
11	NC_015737	GCCG	2	8	650	657	0 %	0 %	50 %	50 %	339441065
12	NC_015737	CAG	2	6	710	715	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339441065
13	NC_015737	CAGG	2	8	737	744	25 %	0 %	50 %	25 %	339441065
14	NC_015737	CCGG	2	8	769	776	0 %	0 %	50 %	50 %	339441065
15	NC_015737	AT	3	6	786	791	50 %	50 %	0 %	0 %	339441065
16	NC_015737	GGAT	2	8	794	801	25 %	25 %	50 %	0 %	339441065
17	NC_015737	TGG	2	6	853	858	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	339441065
18	NC_015737	C	6	6	877	882	0 %	0 %	0 %	100 %	339441065
19	NC_015737	GGCC	2	8	958	965	0 %	0 %	50 %	50 %	339441065
20	NC_015737	CTT	2	6	973	978	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	339441065
21	NC_015737	CAC	2	6	992	997	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	339441065
22	NC_015737	TTC	2	6	1013	1018	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	339441065
23	NC_015737	TTC	2	6	1088	1093	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	339441065
24	NC_015737	TGGA	2	8	1107	1114	25 %	25 %	50 %	0 %	339441065
25	NC_015737	TGC	2	6	1138	1143	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339441065
26	NC_015737	GCGCA	2	10	1145	1154	20 %	0 %	40 %	40 %	339441065
27	NC_015737	TCC	2	6	1164	1169	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	339441065
28	NC_015737	CAG	4	12	1184	1195	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339441065
29	NC_015737	CTG	2	6	1238	1243	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339441065
30	NC_015737	TTC	2	6	1250	1255	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	339441065
31	NC_015737	CGTC	2	8	1278	1285	0 %	25 %	25 %	50 %	339441065
32	NC_015737	GCA	2	6	1309	1314	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339441065
33	NC_015737	TCC	2	6	1343	1348	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	339441065
34	NC_015737	CACCAG	2	12	1349	1360	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	339441065
35	NC_015737	GCC	3	9	1376	1384	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	339441065
36	NC_015737	TTCC	2	8	1469	1476	0 %	50 %	0 %	50 %	339441065
37	NC_015737	CCTG	2	8	1493	1500	0 %	25 %	25 %	50 %	339441065
38	NC_015737	TCCGT	2	10	1513	1522	0 %	40 %	20 %	40 %	339441065
39	NC_015737	CTT	2	6	1525	1530	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	339441065
40	NC_015737	CCAT	2	8	1570	1577	25 %	25 %	0 %	50 %	339441065
41	NC_015737	A	7	7	1608	1614	100 %	0 %	0 %	0 %	339441065
42	NC_015737	T	7	7	1618	1624	0 %	100 %	0 %	0 %	339441065
43	NC_015737	TTC	2	6	1667	1672	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	339441066
44	NC_015737	CTT	2	6	1684	1689	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	339441066
45	NC_015737	TCC	2	6	1791	1796	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	339441066
46	NC_015737	GCG	2	6	1814	1819	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339441066
47	NC_015737	CG	3	6	1827	1832	0 %	0 %	50 %	50 %	339441066
48	NC_015737	CGG	2	6	1912	1917	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339441066
49	NC_015737	TCA	2	6	1939	1944	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	339441066
50	NC_015737	TCT	2	6	1954	1959	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	339441066
51	NC_015737	CTT	2	6	2111	2116	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	339441066
52	NC_015737	ATG	2	6	2160	2165	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	339441066
53	NC_015737	GCA	2	6	2227	2232	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339441066
54	NC_015737	TCA	2	6	2268	2273	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	339441066
55	NC_015737	CGG	2	6	2348	2353	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339441066
56	NC_015737	ATC	2	6	2361	2366	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	339441066
57	NC_015737	AT	3	6	2388	2393	50 %	50 %	0 %	0 %	339441066
58	NC_015737	AGGA	2	8	2496	2503	50 %	0 %	50 %	0 %	339441066
59	NC_015737	TCC	2	6	2577	2582	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	339441066
60	NC_015737	GCA	2	6	2602	2607	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339441066
61	NC_015737	GCT	2	6	2608	2613	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339441066
62	NC_015737	GCCG	2	8	2626	2633	0 %	0 %	50 %	50 %	339441066
63	NC_015737	T	6	6	2717	2722	0 %	100 %	0 %	0 %	339441066
64	NC_015737	TTCT	2	8	2765	2772	0 %	75 %	0 %	25 %	339441066
65	NC_015737	T	6	6	2777	2782	0 %	100 %	0 %	0 %	339441066
66	NC_015737	TCC	2	6	2787	2792	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	339441066
67	NC_015737	CCT	2	6	2806	2811	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	339441066
68	NC_015737	AGT	2	6	2818	2823	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	339441066
69	NC_015737	CCT	2	6	2833	2838	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	339441066
70	NC_015737	GGC	2	6	2924	2929	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339441066
71	NC_015737	CATC	2	8	2932	2939	25 %	25 %	0 %	50 %	339441066
72	NC_015737	CTG	2	6	3051	3056	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339441066
73	NC_015737	GCG	2	6	3135	3140	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339441066
74	NC_015737	ATC	2	6	3186	3191	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	339441066
75	NC_015737	C	6	6	3199	3204	0 %	0 %	0 %	100 %	339441066
76	NC_015737	TCCGC	2	10	3249	3258	0 %	20 %	20 %	60 %	339441066
77	NC_015737	ATC	2	6	3267	3272	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	339441066
78	NC_015737	ACC	2	6	3402	3407	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	339441066
79	NC_015737	CAGG	2	8	3503	3510	25 %	0 %	50 %	25 %	339441066
80	NC_015737	GTT	2	6	3512	3517	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	339441066
81	NC_015737	TCT	2	6	3591	3596	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	339441066
82	NC_015737	CG	3	6	3599	3604	0 %	0 %	50 %	50 %	339441066
83	NC_015737	TTC	2	6	3686	3691	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	339441066
84	NC_015737	CTGC	2	8	3754	3761	0 %	25 %	25 %	50 %	339441066
85	NC_015737	TCA	2	6	3951	3956	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	339441066
86	NC_015737	AGC	2	6	3966	3971	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339441066
87	NC_015737	AGA	2	6	3977	3982	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	339441066
88	NC_015737	TGC	2	6	4023	4028	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339441066
89	NC_015737	AT	3	6	4044	4049	50 %	50 %	0 %	0 %	339441066
90	NC_015737	GAC	2	6	4053	4058	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339441066
91	NC_015737	TAA	2	6	4202	4207	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	339441067
92	NC_015737	CT	3	6	4243	4248	0 %	50 %	0 %	50 %	339441067
93	NC_015737	GGC	2	6	4312	4317	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339441067
94	NC_015737	TCCACA	2	12	4325	4336	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	339441067
95	NC_015737	CG	3	6	4381	4386	0 %	0 %	50 %	50 %	339441067
96	NC_015737	TG	3	6	4411	4416	0 %	50 %	50 %	0 %	339441067
97	NC_015737	GAAG	2	8	4454	4461	50 %	0 %	50 %	0 %	339441067
98	NC_015737	ATCT	2	8	4549	4556	25 %	50 %	0 %	25 %	339441067
99	NC_015737	CAT	2	6	4564	4569	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	339441067
100	NC_015737	TTA	2	6	4737	4742	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	339441068
101	NC_015737	GAA	2	6	4744	4749	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	339441068
102	NC_015737	A	6	6	4748	4753	100 %	0 %	0 %	0 %	339441068
103	NC_015737	T	6	6	4766	4771	0 %	100 %	0 %	0 %	339441068
104	NC_015737	GCA	2	6	4772	4777	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339441068
105	NC_015737	GCT	2	6	4795	4800	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339441068
106	NC_015737	TTC	2	6	4816	4821	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	339441068
107	NC_015737	CTT	2	6	4830	4835	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	339441068
108	NC_015737	TCAG	2	8	4840	4847	25 %	25 %	25 %	25 %	339441068
109	NC_015737	TCAG	2	8	4858	4865	25 %	25 %	25 %	25 %	339441068
110	NC_015737	TCAG	2	8	4876	4883	25 %	25 %	25 %	25 %	339441068
111	NC_015737	GCC	2	6	4895	4900	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	339441068
112	NC_015737	AGA	2	6	4906	4911	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	339441068
113	NC_015737	CTT	2	6	4923	4928	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	339441068
114	NC_015737	CAGG	2	8	4931	4938	25 %	0 %	50 %	25 %	339441068
115	NC_015737	CAG	2	6	4942	4947	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339441068
116	NC_015737	CGG	2	6	4951	4956	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339441068
117	NC_015737	CAGC	2	8	4957	4964	25 %	0 %	25 %	50 %	339441068
118	NC_015737	AACG	2	8	4996	5003	50 %	0 %	25 %	25 %	339441068
119	NC_015737	GCA	2	6	5013	5018	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339441068
120	NC_015737	GCC	3	9	5051	5059	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	339441068
121	NC_015737	GCG	2	6	5139	5144	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339441068
122	NC_015737	AGC	2	6	5250	5255	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339441068
123	NC_015737	CTC	2	6	5287	5292	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	339441068
124	NC_015737	ATCC	2	8	5309	5316	25 %	25 %	0 %	50 %	339441068
125	NC_015737	ATC	2	6	5394	5399	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	339441068
126	NC_015737	AAG	2	6	5423	5428	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	339441068
127	NC_015737	CAT	2	6	5521	5526	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	339441069
128	NC_015737	CAT	2	6	5575	5580	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	339441069
129	NC_015737	CGT	2	6	5613	5618	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339441069
130	NC_015737	T	8	8	5646	5653	0 %	100 %	0 %	0 %	339441069
131	NC_015737	CCA	2	6	5664	5669	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	339441069
132	NC_015737	GGA	2	6	5720	5725	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	339441069
133	NC_015737	GCG	2	6	5748	5753	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339441069
134	NC_015737	CCG	2	6	5909	5914	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	339441069
135	NC_015737	GGCACA	2	12	5946	5957	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339441069
136	NC_015737	CCT	2	6	5969	5974	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	339441069
137	NC_015737	TTC	2	6	5998	6003	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	339441069
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